A lo largo de su historia, la entidad ha visto como su denominación variaba por diversas circunstancias hasta la actual de Fußball-Club Bayern München e.V., vigente desde 1923. El club se fundó bajo el nombre oficial de Fußball-Club Bayern. Equipo filial: Bayern de Múnich II. Como contrapartida, regresaron algunos exjugadores del club como Franco Niell, Sergio Escudero y el arquero Nicolás Navarro, y se incorporó al ex goleador de Gimnasia, Gonzalo Vargas, equipacion real madrid y al promisorio delantero de la reserva xeneize Nicolás Blandi.
